Protein–RNA interactions for Protein: P42575

CASP2, Caspase-2, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP2P42575 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP2P42575 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP2P42575 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP2P42575 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP2P42575 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP2P42575 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP2P42575 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP2P42575 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP2P42575 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP2P42575 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP2P42575 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP2P42575 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP2P42575 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP2P42575 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP2P42575 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP2P42575 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP2P42575 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP2P42575 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP2P42575 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP2P42575 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP2P42575 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP2P42575 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP2P42575 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP2P42575 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP2P42575 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP2P42575 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP2P42575 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP2P42575 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP2P42575 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP2P42575 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP2P42575 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP2P42575 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP2P42575 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP2P42575 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP2P42575 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP2P42575 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP2P42575 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP2P42575 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP2P42575 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP2P42575 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP2P42575 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP2P42575 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP2P42575 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP2P42575 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP2P42575 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP2P42575 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP2P42575 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP2P42575 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP2P42575 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP2P42575 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP2P42575 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP2P42575 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP2P42575 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP2P42575 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP2P42575 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP2P42575 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP2P42575 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP2P42575 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP2P42575 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP2P42575 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP2P42575 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP2P42575 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP2P42575 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP2P42575 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP2P42575 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP2P42575 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP2P42575 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP2P42575 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP2P42575 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP2P42575 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP2P42575 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP2P42575 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP2P42575 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP2P42575 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP2P42575 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP2P42575 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP2P42575 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP2P42575 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP2P42575 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP2P42575 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP2P42575 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP2P42575 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP2P42575 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP2P42575 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP2P42575 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP2P42575 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP2P42575 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP2P42575 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP2P42575 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP2P42575 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP2P42575 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP2P42575 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP2P42575 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP2P42575 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP2P42575 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP2P42575 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP2P42575 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP2P42575 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP2P42575 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CASP2P42575 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms