Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CHRNA7P36544 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms