Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
COPB2P35606 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COPB2P35606 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COPB2P35606 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COPB2P35606 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
COPB2P35606 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COPB2P35606 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
COPB2P35606 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COPB2P35606 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
COPB2P35606 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPB2P35606 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPB2P35606 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPB2P35606 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPB2P35606 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPB2P35606 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPB2P35606 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPB2P35606 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPB2P35606 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPB2P35606 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPB2P35606 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPB2P35606 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPB2P35606 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPB2P35606 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPB2P35606 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPB2P35606 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPB2P35606 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPB2P35606 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPB2P35606 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
COPB2P35606 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPB2P35606 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPB2P35606 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPB2P35606 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
COPB2P35606 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
COPB2P35606 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPB2P35606 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
COPB2P35606 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPB2P35606 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPB2P35606 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPB2P35606 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPB2P35606 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPB2P35606 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPB2P35606 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPB2P35606 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPB2P35606 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPB2P35606 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPB2P35606 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPB2P35606 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPB2P35606 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPB2P35606 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPB2P35606 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPB2P35606 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPB2P35606 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPB2P35606 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPB2P35606 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPB2P35606 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPB2P35606 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPB2P35606 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPB2P35606 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPB2P35606 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPB2P35606 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPB2P35606 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPB2P35606 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPB2P35606 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPB2P35606 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPB2P35606 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPB2P35606 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPB2P35606 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPB2P35606 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPB2P35606 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPB2P35606 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPB2P35606 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
COPB2P35606 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPB2P35606 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPB2P35606 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPB2P35606 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPB2P35606 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPB2P35606 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
COPB2P35606 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPB2P35606 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPB2P35606 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPB2P35606 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
COPB2P35606 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
COPB2P35606 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
COPB2P35606 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
COPB2P35606 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
COPB2P35606 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COPB2P35606 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
COPB2P35606 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COPB2P35606 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COPB2P35606 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
COPB2P35606 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COPB2P35606 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
COPB2P35606 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COPB2P35606 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
COPB2P35606 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COPB2P35606 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COPB2P35606 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COPB2P35606 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COPB2P35606 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COPB2P35606 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms