Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms