Protein–RNA interactions for Protein: P26374

CHML, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMLP26374 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHMLP26374 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHMLP26374 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHMLP26374 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHMLP26374 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHMLP26374 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHMLP26374 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHMLP26374 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHMLP26374 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHMLP26374 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHMLP26374 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHMLP26374 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHMLP26374 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHMLP26374 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHMLP26374 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHMLP26374 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHMLP26374 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHMLP26374 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHMLP26374 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHMLP26374 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHMLP26374 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHMLP26374 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHMLP26374 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHMLP26374 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHMLP26374 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHMLP26374 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHMLP26374 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHMLP26374 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHMLP26374 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHMLP26374 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHMLP26374 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHMLP26374 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHMLP26374 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHMLP26374 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHMLP26374 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHMLP26374 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHMLP26374 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHMLP26374 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHMLP26374 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHMLP26374 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHMLP26374 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHMLP26374 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHMLP26374 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHMLP26374 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHMLP26374 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHMLP26374 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHMLP26374 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHMLP26374 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHMLP26374 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHMLP26374 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHMLP26374 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHMLP26374 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHMLP26374 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHMLP26374 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHMLP26374 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHMLP26374 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHMLP26374 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHMLP26374 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHMLP26374 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHMLP26374 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHMLP26374 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHMLP26374 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHMLP26374 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CHMLP26374 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHMLP26374 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHMLP26374 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHMLP26374 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHMLP26374 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHMLP26374 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHMLP26374 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CHMLP26374 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHMLP26374 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHMLP26374 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHMLP26374 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHMLP26374 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHMLP26374 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHMLP26374 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHMLP26374 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHMLP26374 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHMLP26374 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHMLP26374 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHMLP26374 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHMLP26374 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHMLP26374 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHMLP26374 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHMLP26374 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHMLP26374 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHMLP26374 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHMLP26374 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHMLP26374 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHMLP26374 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHMLP26374 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHMLP26374 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHMLP26374 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHMLP26374 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHMLP26374 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHMLP26374 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHMLP26374 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHMLP26374 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHMLP26374 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms