Protein–RNA interactions for Protein: P16452

EPB42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB42P16452 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EPB42P16452 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EPB42P16452 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EPB42P16452 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EPB42P16452 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
EPB42P16452 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EPB42P16452 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EPB42P16452 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EPB42P16452 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EPB42P16452 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EPB42P16452 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EPB42P16452 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EPB42P16452 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EPB42P16452 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EPB42P16452 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EPB42P16452 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EPB42P16452 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
EPB42P16452 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EPB42P16452 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EPB42P16452 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
EPB42P16452 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EPB42P16452 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
EPB42P16452 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
EPB42P16452 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPB42P16452 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPB42P16452 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPB42P16452 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPB42P16452 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPB42P16452 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPB42P16452 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPB42P16452 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPB42P16452 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPB42P16452 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPB42P16452 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPB42P16452 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPB42P16452 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPB42P16452 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPB42P16452 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPB42P16452 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPB42P16452 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPB42P16452 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPB42P16452 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPB42P16452 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPB42P16452 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPB42P16452 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPB42P16452 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPB42P16452 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPB42P16452 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPB42P16452 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPB42P16452 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
EPB42P16452 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPB42P16452 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPB42P16452 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPB42P16452 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPB42P16452 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPB42P16452 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
EPB42P16452 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPB42P16452 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPB42P16452 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPB42P16452 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPB42P16452 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPB42P16452 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPB42P16452 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPB42P16452 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPB42P16452 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPB42P16452 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPB42P16452 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPB42P16452 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPB42P16452 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPB42P16452 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPB42P16452 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPB42P16452 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPB42P16452 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPB42P16452 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPB42P16452 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPB42P16452 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPB42P16452 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPB42P16452 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPB42P16452 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPB42P16452 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPB42P16452 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPB42P16452 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPB42P16452 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPB42P16452 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPB42P16452 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPB42P16452 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPB42P16452 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPB42P16452 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPB42P16452 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPB42P16452 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPB42P16452 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPB42P16452 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPB42P16452 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPB42P16452 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPB42P16452 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
EPB42P16452 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPB42P16452 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPB42P16452 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPB42P16452 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPB42P16452 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms