Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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LRRTM2O43300 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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LRRTM2O43300 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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LRRTM2O43300 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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LRRTM2O43300 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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