Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SMIM1B2RUZ4 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms