Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X0

MED16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, humanhuman

Predictions only

Length 877 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED16Q9Y2X0 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MED16Q9Y2X0 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MED16Q9Y2X0 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MED16Q9Y2X0 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MED16Q9Y2X0 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MED16Q9Y2X0 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MED16Q9Y2X0 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MED16Q9Y2X0 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MED16Q9Y2X0 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MED16Q9Y2X0 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MED16Q9Y2X0 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
MED16Q9Y2X0 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MED16Q9Y2X0 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MED16Q9Y2X0 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MED16Q9Y2X0 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MED16Q9Y2X0 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MED16Q9Y2X0 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MED16Q9Y2X0 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
MED16Q9Y2X0 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MED16Q9Y2X0 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
MED16Q9Y2X0 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
MED16Q9Y2X0 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED16Q9Y2X0 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED16Q9Y2X0 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED16Q9Y2X0 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED16Q9Y2X0 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED16Q9Y2X0 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED16Q9Y2X0 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED16Q9Y2X0 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED16Q9Y2X0 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED16Q9Y2X0 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED16Q9Y2X0 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED16Q9Y2X0 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED16Q9Y2X0 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED16Q9Y2X0 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED16Q9Y2X0 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED16Q9Y2X0 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED16Q9Y2X0 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED16Q9Y2X0 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED16Q9Y2X0 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED16Q9Y2X0 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED16Q9Y2X0 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED16Q9Y2X0 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED16Q9Y2X0 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MED16Q9Y2X0 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED16Q9Y2X0 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED16Q9Y2X0 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED16Q9Y2X0 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED16Q9Y2X0 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED16Q9Y2X0 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED16Q9Y2X0 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED16Q9Y2X0 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED16Q9Y2X0 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MED16Q9Y2X0 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED16Q9Y2X0 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED16Q9Y2X0 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED16Q9Y2X0 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED16Q9Y2X0 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MED16Q9Y2X0 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED16Q9Y2X0 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED16Q9Y2X0 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED16Q9Y2X0 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED16Q9Y2X0 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED16Q9Y2X0 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED16Q9Y2X0 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED16Q9Y2X0 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MED16Q9Y2X0 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED16Q9Y2X0 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED16Q9Y2X0 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED16Q9Y2X0 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED16Q9Y2X0 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED16Q9Y2X0 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED16Q9Y2X0 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED16Q9Y2X0 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED16Q9Y2X0 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED16Q9Y2X0 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED16Q9Y2X0 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED16Q9Y2X0 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED16Q9Y2X0 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED16Q9Y2X0 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED16Q9Y2X0 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED16Q9Y2X0 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED16Q9Y2X0 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED16Q9Y2X0 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED16Q9Y2X0 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED16Q9Y2X0 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED16Q9Y2X0 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED16Q9Y2X0 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED16Q9Y2X0 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED16Q9Y2X0 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED16Q9Y2X0 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED16Q9Y2X0 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED16Q9Y2X0 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED16Q9Y2X0 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED16Q9Y2X0 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED16Q9Y2X0 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MED16Q9Y2X0 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED16Q9Y2X0 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MED16Q9Y2X0 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MED16Q9Y2X0 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms