Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NKX1-2Q9UD57 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms