Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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COPS7AQ9UBW8 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
COPS7AQ9UBW8 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
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COPS7AQ9UBW8 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
COPS7AQ9UBW8 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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