Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN7

HDAC6, Histone deacetylase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6Q9UBN7 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HDAC6Q9UBN7 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HDAC6Q9UBN7 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDAC6Q9UBN7 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDAC6Q9UBN7 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDAC6Q9UBN7 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDAC6Q9UBN7 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDAC6Q9UBN7 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HDAC6Q9UBN7 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HDAC6Q9UBN7 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HDAC6Q9UBN7 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HDAC6Q9UBN7 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HDAC6Q9UBN7 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HDAC6Q9UBN7 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HDAC6Q9UBN7 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HDAC6Q9UBN7 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HDAC6Q9UBN7 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HDAC6Q9UBN7 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HDAC6Q9UBN7 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HDAC6Q9UBN7 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HDAC6Q9UBN7 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HDAC6Q9UBN7 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HDAC6Q9UBN7 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HDAC6Q9UBN7 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HDAC6Q9UBN7 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
HDAC6Q9UBN7 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HDAC6Q9UBN7 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HDAC6Q9UBN7 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HDAC6Q9UBN7 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HDAC6Q9UBN7 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HDAC6Q9UBN7 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HDAC6Q9UBN7 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HDAC6Q9UBN7 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HDAC6Q9UBN7 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HDAC6Q9UBN7 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
HDAC6Q9UBN7 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HDAC6Q9UBN7 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HDAC6Q9UBN7 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
HDAC6Q9UBN7 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
HDAC6Q9UBN7 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HDAC6Q9UBN7 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HDAC6Q9UBN7 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HDAC6Q9UBN7 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HDAC6Q9UBN7 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HDAC6Q9UBN7 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HDAC6Q9UBN7 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HDAC6Q9UBN7 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HDAC6Q9UBN7 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HDAC6Q9UBN7 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HDAC6Q9UBN7 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HDAC6Q9UBN7 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HDAC6Q9UBN7 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HDAC6Q9UBN7 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HDAC6Q9UBN7 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HDAC6Q9UBN7 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HDAC6Q9UBN7 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HDAC6Q9UBN7 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC6Q9UBN7 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC6Q9UBN7 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC6Q9UBN7 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC6Q9UBN7 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC6Q9UBN7 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC6Q9UBN7 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC6Q9UBN7 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC6Q9UBN7 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC6Q9UBN7 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC6Q9UBN7 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC6Q9UBN7 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC6Q9UBN7 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC6Q9UBN7 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC6Q9UBN7 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC6Q9UBN7 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC6Q9UBN7 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC6Q9UBN7 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC6Q9UBN7 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC6Q9UBN7 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC6Q9UBN7 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC6Q9UBN7 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC6Q9UBN7 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC6Q9UBN7 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC6Q9UBN7 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC6Q9UBN7 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC6Q9UBN7 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC6Q9UBN7 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC6Q9UBN7 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC6Q9UBN7 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC6Q9UBN7 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC6Q9UBN7 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC6Q9UBN7 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC6Q9UBN7 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC6Q9UBN7 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC6Q9UBN7 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC6Q9UBN7 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC6Q9UBN7 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HDAC6Q9UBN7 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDAC6Q9UBN7 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDAC6Q9UBN7 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDAC6Q9UBN7 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDAC6Q9UBN7 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HDAC6Q9UBN7 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms