Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RAB6BQ9NRW1 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB6BQ9NRW1 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms