Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP77

SSU72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSU72Q9NP77 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSU72Q9NP77 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.8 ms