Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NLRP1Q9C000 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms