Protein–RNA interactions for Protein: Q99895

CTRC, Chymotrypsin-C, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRCQ99895 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTRCQ99895 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms