Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC9.07□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC9.07□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 AKNA-202ENST00000307564 7380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 CACNA1G-207ENST00000429973 7120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 SRPK3-208ENST00000489426 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 PDE12-201ENST00000311180 8773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 CENPP-203ENST00000375587 8766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 NAPB-202ENST00000398425 3824 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 AC010336.1-201ENST00000539278 4739 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 TMEM131L-203ENST00000409959 5017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC9.07□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 XIRP1-201ENST00000340369 6460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 PIK3CD-202ENST00000377346 5203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 MAP4K2-201ENST00000294066 7178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 ARHGEF10L-202ENST00000361221 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 STRC-213ENST00000541030 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC9.06□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC9.06□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC9.06□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 SCN8A-209ENST00000627620 5943 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 SEC23A-201ENST00000307712 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 TWSG1-201ENST00000262120 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 SCARB2-215ENST00000639145 4471 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
LINC00208Q96KT6 CAMTA2-204ENST00000414043 4589 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms