Protein–RNA interactions for Protein: Q96C92

SDCCAG3, Serologically defined colon cancer antigen 3, humanhuman

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Length 435 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCCAG3Q96C92 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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SDCCAG3Q96C92 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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SDCCAG3Q96C92 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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SDCCAG3Q96C92 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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SDCCAG3Q96C92 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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SDCCAG3Q96C92 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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SDCCAG3Q96C92 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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SDCCAG3Q96C92 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
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