Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ3

C9orf40, Uncharacterized protein C9orf40, humanhuman

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf40Q8IXQ3 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf40Q8IXQ3 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf40Q8IXQ3 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf40Q8IXQ3 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf40Q8IXQ3 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf40Q8IXQ3 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf40Q8IXQ3 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf40Q8IXQ3 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf40Q8IXQ3 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
C9orf40Q8IXQ3 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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C9orf40Q8IXQ3 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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C9orf40Q8IXQ3 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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C9orf40Q8IXQ3 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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C9orf40Q8IXQ3 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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C9orf40Q8IXQ3 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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C9orf40Q8IXQ3 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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C9orf40Q8IXQ3 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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C9orf40Q8IXQ3 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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C9orf40Q8IXQ3 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
C9orf40Q8IXQ3 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
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