Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNMB4Q86W47 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms