Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI14

SLC9A4, Sodium/hydrogen exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A4Q6AI14 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SLC9A4Q6AI14 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms