Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms