Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms