Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC6Q16204 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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