Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

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Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
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UBE3CQ15386 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
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UBE3CQ15386 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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UBE3CQ15386 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UBE3CQ15386 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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