Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RAB39AQ14964 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms