Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CUL4AQ13619 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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