Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
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PTP4A2Q12974 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTP4A2Q12974 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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