Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms