Protein–RNA interactions for Protein: Q03181

PPARD, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARDQ03181 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PPARDQ03181 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PPARDQ03181 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PPARDQ03181 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PPARDQ03181 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PPARDQ03181 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PPARDQ03181 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PPARDQ03181 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PPARDQ03181 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PPARDQ03181 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PPARDQ03181 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PPARDQ03181 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PPARDQ03181 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PPARDQ03181 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PPARDQ03181 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PPARDQ03181 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PPARDQ03181 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PPARDQ03181 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PPARDQ03181 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PPARDQ03181 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PPARDQ03181 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PPARDQ03181 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PPARDQ03181 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PPARDQ03181 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PPARDQ03181 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PPARDQ03181 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PPARDQ03181 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PPARDQ03181 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PPARDQ03181 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PPARDQ03181 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PPARDQ03181 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PPARDQ03181 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PPARDQ03181 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PPARDQ03181 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PPARDQ03181 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PPARDQ03181 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PPARDQ03181 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PPARDQ03181 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PPARDQ03181 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PPARDQ03181 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PPARDQ03181 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PPARDQ03181 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PPARDQ03181 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PPARDQ03181 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PPARDQ03181 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PPARDQ03181 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PPARDQ03181 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PPARDQ03181 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PPARDQ03181 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PPARDQ03181 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PPARDQ03181 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PPARDQ03181 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PPARDQ03181 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PPARDQ03181 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PPARDQ03181 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PPARDQ03181 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PPARDQ03181 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PPARDQ03181 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PPARDQ03181 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PPARDQ03181 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PPARDQ03181 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PPARDQ03181 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PPARDQ03181 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PPARDQ03181 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PPARDQ03181 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PPARDQ03181 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PPARDQ03181 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PPARDQ03181 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PPARDQ03181 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PPARDQ03181 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PPARDQ03181 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PPARDQ03181 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PPARDQ03181 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PPARDQ03181 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PPARDQ03181 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PPARDQ03181 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PPARDQ03181 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PPARDQ03181 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PPARDQ03181 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PPARDQ03181 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PPARDQ03181 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PPARDQ03181 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PPARDQ03181 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PPARDQ03181 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PPARDQ03181 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PPARDQ03181 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PPARDQ03181 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PPARDQ03181 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PPARDQ03181 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PPARDQ03181 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PPARDQ03181 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PPARDQ03181 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PPARDQ03181 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PPARDQ03181 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PPARDQ03181 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PPARDQ03181 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PPARDQ03181 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PPARDQ03181 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PPARDQ03181 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PPARDQ03181 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms