Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CAV1Q03135 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CAV1Q03135 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CAV1Q03135 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CAV1Q03135 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CAV1Q03135 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CAV1Q03135 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CAV1Q03135 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CAV1Q03135 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CAV1Q03135 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CAV1Q03135 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CAV1Q03135 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CAV1Q03135 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CAV1Q03135 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CAV1Q03135 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CAV1Q03135 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CAV1Q03135 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CAV1Q03135 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CAV1Q03135 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CAV1Q03135 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CAV1Q03135 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CAV1Q03135 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CAV1Q03135 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CAV1Q03135 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CAV1Q03135 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CAV1Q03135 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CAV1Q03135 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms