Protein–RNA interactions for Protein: Q02297

NRG1, Pro-neuregulin-1, membrane-bound isoform, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRG1Q02297 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NRG1Q02297 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms