Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
BNC1Q01954 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNC1Q01954 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms