Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNTBP49356 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNTBP49356 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNTBP49356 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNTBP49356 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNTBP49356 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNTBP49356 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNTBP49356 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNTBP49356 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNTBP49356 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FNTBP49356 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNTBP49356 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FNTBP49356 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNTBP49356 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNTBP49356 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNTBP49356 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FNTBP49356 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FNTBP49356 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNTBP49356 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNTBP49356 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FNTBP49356 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNTBP49356 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FNTBP49356 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNTBP49356 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNTBP49356 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNTBP49356 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNTBP49356 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNTBP49356 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNTBP49356 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNTBP49356 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNTBP49356 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNTBP49356 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNTBP49356 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNTBP49356 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FNTBP49356 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNTBP49356 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNTBP49356 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNTBP49356 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNTBP49356 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNTBP49356 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNTBP49356 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNTBP49356 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNTBP49356 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNTBP49356 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNTBP49356 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNTBP49356 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNTBP49356 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNTBP49356 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNTBP49356 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNTBP49356 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNTBP49356 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNTBP49356 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNTBP49356 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNTBP49356 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNTBP49356 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNTBP49356 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNTBP49356 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNTBP49356 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNTBP49356 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNTBP49356 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FNTBP49356 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNTBP49356 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNTBP49356 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNTBP49356 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNTBP49356 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNTBP49356 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNTBP49356 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNTBP49356 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNTBP49356 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FNTBP49356 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNTBP49356 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNTBP49356 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNTBP49356 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNTBP49356 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNTBP49356 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNTBP49356 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNTBP49356 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNTBP49356 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNTBP49356 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNTBP49356 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNTBP49356 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNTBP49356 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNTBP49356 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNTBP49356 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNTBP49356 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNTBP49356 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNTBP49356 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNTBP49356 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNTBP49356 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNTBP49356 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNTBP49356 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FNTBP49356 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNTBP49356 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNTBP49356 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNTBP49356 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNTBP49356 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNTBP49356 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNTBP49356 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNTBP49356 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FNTBP49356 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms