Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD12P35452 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms