Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GTF2E1P29083 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms