Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PSMB9P28065 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PSMB9P28065 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PSMB9P28065 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PSMB9P28065 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PSMB9P28065 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PSMB9P28065 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PSMB9P28065 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PSMB9P28065 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
PSMB9P28065 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PSMB9P28065 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PSMB9P28065 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PSMB9P28065 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PSMB9P28065 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PSMB9P28065 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PSMB9P28065 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PSMB9P28065 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PSMB9P28065 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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PSMB9P28065 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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PSMB9P28065 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
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PSMB9P28065 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
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PSMB9P28065 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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