Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTN1P12814 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms