Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GLI3P10071 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GLI3P10071 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GLI3P10071 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GLI3P10071 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
GLI3P10071 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GLI3P10071 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
GLI3P10071 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
GLI3P10071 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GLI3P10071 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GLI3P10071 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
GLI3P10071 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GLI3P10071 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
GLI3P10071 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GLI3P10071 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
GLI3P10071 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GLI3P10071 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GLI3P10071 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GLI3P10071 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GLI3P10071 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GLI3P10071 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GLI3P10071 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GLI3P10071 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GLI3P10071 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GLI3P10071 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GLI3P10071 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GLI3P10071 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GLI3P10071 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GLI3P10071 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GLI3P10071 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GLI3P10071 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GLI3P10071 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GLI3P10071 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GLI3P10071 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GLI3P10071 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GLI3P10071 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GLI3P10071 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GLI3P10071 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GLI3P10071 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GLI3P10071 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GLI3P10071 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GLI3P10071 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GLI3P10071 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GLI3P10071 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GLI3P10071 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GLI3P10071 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GLI3P10071 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GLI3P10071 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GLI3P10071 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GLI3P10071 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GLI3P10071 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GLI3P10071 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GLI3P10071 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GLI3P10071 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GLI3P10071 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GLI3P10071 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GLI3P10071 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GLI3P10071 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GLI3P10071 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GLI3P10071 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GLI3P10071 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GLI3P10071 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GLI3P10071 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GLI3P10071 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GLI3P10071 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GLI3P10071 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GLI3P10071 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GLI3P10071 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GLI3P10071 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GLI3P10071 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GLI3P10071 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GLI3P10071 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GLI3P10071 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GLI3P10071 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GLI3P10071 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GLI3P10071 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GLI3P10071 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GLI3P10071 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GLI3P10071 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GLI3P10071 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GLI3P10071 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GLI3P10071 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GLI3P10071 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GLI3P10071 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GLI3P10071 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GLI3P10071 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GLI3P10071 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GLI3P10071 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GLI3P10071 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GLI3P10071 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GLI3P10071 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GLI3P10071 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GLI3P10071 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GLI3P10071 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GLI3P10071 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GLI3P10071 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GLI3P10071 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GLI3P10071 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GLI3P10071 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GLI3P10071 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms