Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TMEM225BP0DP42 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TMEM225BP0DP42 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TMEM225BP0DP42 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TMEM225BP0DP42 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
TMEM225BP0DP42 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TMEM225BP0DP42 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TMEM225BP0DP42 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TMEM225BP0DP42 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TMEM225BP0DP42 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TMEM225BP0DP42 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TMEM225BP0DP42 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TMEM225BP0DP42 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TMEM225BP0DP42 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TMEM225BP0DP42 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TMEM225BP0DP42 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TMEM225BP0DP42 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TMEM225BP0DP42 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TMEM225BP0DP42 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TMEM225BP0DP42 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
TMEM225BP0DP42 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TMEM225BP0DP42 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TMEM225BP0DP42 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TMEM225BP0DP42 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TMEM225BP0DP42 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TMEM225BP0DP42 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TMEM225BP0DP42 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TMEM225BP0DP42 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TMEM225BP0DP42 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TMEM225BP0DP42 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TMEM225BP0DP42 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
TMEM225BP0DP42 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TMEM225BP0DP42 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TMEM225BP0DP42 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TMEM225BP0DP42 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TMEM225BP0DP42 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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TMEM225BP0DP42 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
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TMEM225BP0DP42 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
TMEM225BP0DP42 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TMEM225BP0DP42 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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TMEM225BP0DP42 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
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TMEM225BP0DP42 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TMEM225BP0DP42 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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TMEM225BP0DP42 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TMEM225BP0DP42 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
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TMEM225BP0DP42 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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TMEM225BP0DP42 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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TMEM225BP0DP42 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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TMEM225BP0DP42 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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TMEM225BP0DP42 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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TMEM225BP0DP42 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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TMEM225BP0DP42 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TMEM225BP0DP42 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TMEM225BP0DP42 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TMEM225BP0DP42 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TMEM225BP0DP42 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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TMEM225BP0DP42 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TMEM225BP0DP42 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
TMEM225BP0DP42 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
TMEM225BP0DP42 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TMEM225BP0DP42 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
TMEM225BP0DP42 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TMEM225BP0DP42 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TMEM225BP0DP42 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TMEM225BP0DP42 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TMEM225BP0DP42 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TMEM225BP0DP42 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TMEM225BP0DP42 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TMEM225BP0DP42 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TMEM225BP0DP42 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TMEM225BP0DP42 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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