Protein–RNA interactions for Protein: P05230

FGF1, Fibroblast growth factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGF1P05230 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FGF1P05230 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FGF1P05230 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FGF1P05230 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FGF1P05230 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FGF1P05230 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FGF1P05230 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FGF1P05230 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FGF1P05230 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FGF1P05230 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FGF1P05230 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGF1P05230 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGF1P05230 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGF1P05230 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGF1P05230 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGF1P05230 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGF1P05230 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FGF1P05230 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGF1P05230 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGF1P05230 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGF1P05230 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FGF1P05230 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGF1P05230 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGF1P05230 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGF1P05230 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGF1P05230 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FGF1P05230 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGF1P05230 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGF1P05230 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FGF1P05230 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGF1P05230 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGF1P05230 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGF1P05230 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGF1P05230 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGF1P05230 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGF1P05230 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGF1P05230 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGF1P05230 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGF1P05230 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGF1P05230 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGF1P05230 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGF1P05230 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGF1P05230 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGF1P05230 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGF1P05230 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGF1P05230 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGF1P05230 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FGF1P05230 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FGF1P05230 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FGF1P05230 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FGF1P05230 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FGF1P05230 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FGF1P05230 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FGF1P05230 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FGF1P05230 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FGF1P05230 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FGF1P05230 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FGF1P05230 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FGF1P05230 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FGF1P05230 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FGF1P05230 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FGF1P05230 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FGF1P05230 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FGF1P05230 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FGF1P05230 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FGF1P05230 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FGF1P05230 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FGF1P05230 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FGF1P05230 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FGF1P05230 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FGF1P05230 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FGF1P05230 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FGF1P05230 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FGF1P05230 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FGF1P05230 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FGF1P05230 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FGF1P05230 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FGF1P05230 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FGF1P05230 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FGF1P05230 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGF1P05230 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGF1P05230 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGF1P05230 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGF1P05230 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGF1P05230 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGF1P05230 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGF1P05230 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGF1P05230 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGF1P05230 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGF1P05230 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGF1P05230 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGF1P05230 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGF1P05230 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGF1P05230 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGF1P05230 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FGF1P05230 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FGF1P05230 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGF1P05230 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGF1P05230 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FGF1P05230 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms