Protein–RNA interactions for Protein: O95219

SNX4, Sorting nexin-4, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX4O95219 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SNX4O95219 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX4O95219 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX4O95219 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX4O95219 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX4O95219 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNX4O95219 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SNX4O95219 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX4O95219 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX4O95219 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX4O95219 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX4O95219 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX4O95219 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SNX4O95219 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX4O95219 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX4O95219 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX4O95219 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX4O95219 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX4O95219 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX4O95219 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX4O95219 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX4O95219 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX4O95219 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX4O95219 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX4O95219 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX4O95219 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX4O95219 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SNX4O95219 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX4O95219 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX4O95219 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX4O95219 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX4O95219 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX4O95219 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX4O95219 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX4O95219 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX4O95219 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX4O95219 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX4O95219 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX4O95219 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX4O95219 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX4O95219 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX4O95219 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX4O95219 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX4O95219 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX4O95219 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX4O95219 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SNX4O95219 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX4O95219 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX4O95219 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SNX4O95219 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SNX4O95219 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SNX4O95219 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SNX4O95219 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SNX4O95219 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SNX4O95219 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SNX4O95219 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SNX4O95219 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SNX4O95219 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SNX4O95219 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SNX4O95219 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.05■□□□□ 0
SNX4O95219 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SNX4O95219 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNX4O95219 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNX4O95219 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SNX4O95219 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNX4O95219 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNX4O95219 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNX4O95219 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SNX4O95219 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNX4O95219 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SNX4O95219 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SNX4O95219 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SNX4O95219 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SNX4O95219 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SNX4O95219 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SNX4O95219 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNX4O95219 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SNX4O95219 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SNX4O95219 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SNX4O95219 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNX4O95219 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SNX4O95219 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SNX4O95219 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNX4O95219 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SNX4O95219 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNX4O95219 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SNX4O95219 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SNX4O95219 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNX4O95219 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNX4O95219 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SNX4O95219 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNX4O95219 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SNX4O95219 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNX4O95219 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNX4O95219 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SNX4O95219 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SNX4O95219 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNX4O95219 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SNX4O95219 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNX4O95219 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms