Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLOCKO15516 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLOCKO15516 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CLOCKO15516 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLOCKO15516 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLOCKO15516 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLOCKO15516 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLOCKO15516 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLOCKO15516 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CLOCKO15516 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLOCKO15516 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLOCKO15516 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLOCKO15516 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLOCKO15516 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLOCKO15516 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLOCKO15516 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLOCKO15516 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLOCKO15516 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLOCKO15516 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLOCKO15516 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLOCKO15516 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLOCKO15516 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLOCKO15516 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLOCKO15516 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLOCKO15516 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLOCKO15516 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLOCKO15516 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLOCKO15516 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CLOCKO15516 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLOCKO15516 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLOCKO15516 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CLOCKO15516 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CLOCKO15516 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLOCKO15516 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLOCKO15516 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLOCKO15516 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLOCKO15516 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLOCKO15516 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLOCKO15516 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLOCKO15516 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLOCKO15516 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLOCKO15516 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLOCKO15516 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLOCKO15516 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLOCKO15516 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLOCKO15516 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLOCKO15516 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLOCKO15516 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLOCKO15516 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLOCKO15516 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLOCKO15516 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CLOCKO15516 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLOCKO15516 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLOCKO15516 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLOCKO15516 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLOCKO15516 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLOCKO15516 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLOCKO15516 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLOCKO15516 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLOCKO15516 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLOCKO15516 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLOCKO15516 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLOCKO15516 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLOCKO15516 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLOCKO15516 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLOCKO15516 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLOCKO15516 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLOCKO15516 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLOCKO15516 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLOCKO15516 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLOCKO15516 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CLOCKO15516 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLOCKO15516 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLOCKO15516 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLOCKO15516 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLOCKO15516 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLOCKO15516 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLOCKO15516 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLOCKO15516 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLOCKO15516 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CLOCKO15516 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CLOCKO15516 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLOCKO15516 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLOCKO15516 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLOCKO15516 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLOCKO15516 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLOCKO15516 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CLOCKO15516 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLOCKO15516 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLOCKO15516 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLOCKO15516 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CLOCKO15516 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLOCKO15516 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLOCKO15516 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CLOCKO15516 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLOCKO15516 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLOCKO15516 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLOCKO15516 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLOCKO15516 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CLOCKO15516 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms