Protein–RNA interactions for Protein: Q99062

CSF3R, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF3RQ99062 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms