Protein–RNA interactions for Protein: Q969S2

NEIL2, Endonuclease 8-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL2Q969S2 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
NEIL2Q969S2 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEIL2Q969S2 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEIL2Q969S2 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEIL2Q969S2 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEIL2Q969S2 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEIL2Q969S2 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEIL2Q969S2 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEIL2Q969S2 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEIL2Q969S2 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEIL2Q969S2 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEIL2Q969S2 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms