Protein–RNA interactions for Protein: Q92838

EDA, Ectodysplasin-A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDAQ92838 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EDAQ92838 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EDAQ92838 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EDAQ92838 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EDAQ92838 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EDAQ92838 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EDAQ92838 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EDAQ92838 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EDAQ92838 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EDAQ92838 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EDAQ92838 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EDAQ92838 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EDAQ92838 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EDAQ92838 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
EDAQ92838 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EDAQ92838 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EDAQ92838 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EDAQ92838 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EDAQ92838 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EDAQ92838 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
EDAQ92838 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EDAQ92838 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EDAQ92838 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EDAQ92838 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
EDAQ92838 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EDAQ92838 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EDAQ92838 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EDAQ92838 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EDAQ92838 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EDAQ92838 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EDAQ92838 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
EDAQ92838 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EDAQ92838 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EDAQ92838 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EDAQ92838 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EDAQ92838 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EDAQ92838 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EDAQ92838 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EDAQ92838 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EDAQ92838 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EDAQ92838 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EDAQ92838 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EDAQ92838 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EDAQ92838 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EDAQ92838 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EDAQ92838 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16■□□□□ 0.15
EDAQ92838 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EDAQ92838 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EDAQ92838 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EDAQ92838 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EDAQ92838 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EDAQ92838 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EDAQ92838 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EDAQ92838 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EDAQ92838 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EDAQ92838 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EDAQ92838 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EDAQ92838 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EDAQ92838 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
EDAQ92838 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EDAQ92838 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EDAQ92838 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC16■□□□□ 0.15
EDAQ92838 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
EDAQ92838 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EDAQ92838 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16■□□□□ 0.15
EDAQ92838 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
EDAQ92838 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EDAQ92838 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EDAQ92838 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
EDAQ92838 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EDAQ92838 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC16■□□□□ 0.15
EDAQ92838 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EDAQ92838 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
EDAQ92838 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16■□□□□ 0.15
EDAQ92838 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EDAQ92838 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC16■□□□□ 0.15
EDAQ92838 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC16■□□□□ 0.15
EDAQ92838 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EDAQ92838 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EDAQ92838 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EDAQ92838 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EDAQ92838 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EDAQ92838 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16■□□□□ 0.15
EDAQ92838 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
EDAQ92838 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EDAQ92838 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EDAQ92838 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EDAQ92838 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EDAQ92838 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EDAQ92838 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EDAQ92838 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EDAQ92838 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EDAQ92838 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EDAQ92838 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EDAQ92838 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EDAQ92838 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EDAQ92838 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EDAQ92838 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EDAQ92838 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EDAQ92838 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms