Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC12Q8WUD4 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.8 ms