Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA56

TTC29, Tetratricopeptide repeat protein 29, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC29Q8NA56 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTC29Q8NA56 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms