Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD40Q6AI12 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms