Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CTXN3Q4LDR2 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CTXN3Q4LDR2 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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